Deze pepers zijn in feite gerookte Habanero-pepers, die veel worden gebruikt in de Mexicaans-Spaanse keuken. Chipotles hebben warmte en een kenmerkende rooksmaak. Het vruchtvlees is dik, dus de pepers worden meestal gebruikt in een langzaam gekookt gerecht in plaats van rauw. Hele chipotles worden toegevoegd aan soepen, stoofschotels of in de bouillon voor vlees. Ze kunnen ook bij bonen of linzen worden geserveerd. Ook bekend als gerookte habanero met een Scoville-hitte = 200.000