Au XVIe siècle, le cantuccio était un aliment courant pour les familles paysannes. En fait, avec le boom du sucre de cette période, les boulangers préparaient des miches de pain sucré pour les clients fortunés et les morceaux jetés, surnommés cantuccini, étaient plutôt destinés aux familles paysannes et roturières. Grâce à l'intuition de Caterina de' Medici, une délicieuse connaisseuse de gastronomie, la recette des cantuccini a été enrichie d'amandes pelées et a rapidement été connue dans toute l'Europe. En 1691, l'Accademia della Crusca a défini les cantuccini comme des « biscuits tranchés, faits de farine de fleurs, avec du sucre et du blanc d'œuf », mais ce n'est qu'en 1779 que le spécialiste de Prato Amadio Baldanzi a codifié la première recette officielle.